EGB, Chemie

Auch in Chemie hat sich in den letzen 5 Jahren das Netz mit Information gefüllt. Wieder sind die amerikanischen und englischen Internet-Seiten vorbildlich.
In den letzten 15 Jahren hat es mir vor allem die 3D-Struktur biologischer Moleküle angetan, um den Schülern eine bessere Vorstellung von Molekülstrukturen zu verschaffen.
Nach Fertigstellung des Biokurses wollte ich eigentlich nicht dasselbe mit Chemie machen habe aber doch ab dem Schuljahr 2001/2002 den Rappel bekommen und begonnen den Chemiekurs Klasse 11 zu schreiben.

Chemiekurs Klasse 11
3D-Molekülanimation
Links Chemie/Ernährungslehre

Der Chemiekurs ist wie der Biokurs aufgebaut: praxis- und technikorientierte Inhalte gegliedert nach dem Lehrplan der beruflichen Gymnasien in BW, Trainingsmöglichkeiten wie Stichwortlisten, Glossare, Automatische Tests, Kreuzworträtsel.

Themen: Energie und Materie, Atommodelle und PSE, Bindungen, Reaktionskinetik, Protolysen, Redoxreaktionen.

Molekülanimation:

Im Biologie und Chemie-(Ernährungslehre)lehrplan des beruflichen Gymnasiums soll die Proteinstruktur vermittelt werden. Dazu eignet sich ein Computermodell hervorragend. 3D-Molekülanimatoren stellen ausgewählte Moleküle dreidimensional dar und läßt sie durch Mausclick drehen. Es gibt im WWW mehrere Möglichkeiten Moleküle (vor allem komlexe) zu visualisieren:

1. Mit dem Browser-Plugin CHIME,
2. mit RASMOL (s.unten)
3. oder anderen Molekül-Viewern (s. unten)

1. Mit dem CHIME-Plugin können online oder offline Moleküle und Stoffwechsel-abschnitte wie Glycolyse animiert werden. Das Plugin kann unter dem Communicator und Internet-Explorer verwendet werden. Unter nachfolgender Adresse kann man es herunterladen.

Aminosäuren/Peptide	Proteine	Nukleinsäuren/KH/Sonstiges
Glucagon (Helixstruktur)	Cytochrom B562 (Proteid)	DNA synthetisch, Ausschnitt
Mellitin (Helixstruktur)	Cytochrom C (Proteid)	t-RNA Phe (L-Form)
Insulin (Globulärstruktur)	Katalase (Tertiärstruktur mit Helix, Faltblatt und NADP)	t-RNA Asp (L-Form)
Relaxin (Tertiärstruktur)	Myosin (Helix)	Agarose (Oligosaccharid)
Tetrapeptid (Primärstruktur)	Hämoglobin (Quartärstruktur)	Galactose (Monosaccharid)
	Urease (Tertiärstruktur)
	CRO-Repressor
	Hexokinase (Tertiärstruktur mit Inhibitor)
	Myoglobin (Proteid mit Häm)
	Bacteriochlorophyllprotein (Tertiärstruktur mit Faltblatt)

Ca. 100 Moleküle finden Sie hier:

3. Hostbasierte PDB-Browser (je nach Netzgeschwindigkeit unregelmäßige Animation)

Brookhaven PDB3-Browser

(

http://www.rcsb.org

)

PDB3-Browser

(

http://www.embl-heidelberg.de/cgi/viewer.pl)

Eine Unzahl kleiner Moleküle findet man in : http://www.ibc.wustl.edu/moirai/klotho/compound_list.html

Weitere Informationen zum Thema "komplexe Moleküle in 3D" siehe BIOKURS 2001 !!!!

Chemie/Ernährungslehre am EG in Baden-Württemberg

Für die Nutzung der Chemie-Power aus dem Internet sollten folgende Browser-Plugins installiert sein:


CHIME	Apple Quicktime	Makromedia Flash	Acrobat Reader	Makromedia Shockwave

Chemische Suchmaschinen

ChemSpy
Chemische Suchmaschinen

Chemie-Software
Bei der hier empfohlenen Chemiesoftware wurde auf Qualität, freie Verfügbarkeit und Internettauglichkeit Wert gelegt:

CHIME Freeware Tutorial, Tips, Hilfsprogramme dazu	Molekülviewer und Animationsgenerator

ACD/Chemsketch 4.5 Freeware	Chemisches Zeichen- und Grafikprogramm
ChemWeb 3.1	Chemisches Zeichenprogramm
ChemLab	Interaktive Chemielabor-Simulation
GraphPad	Datenanalyse Software

PSEs

Rutherford Eines der besten PSEs Online

Linkliste von PSEs ca. 30 verschiedene PSEs für alle Geschmäcker

Nomenklatur

IUPAC Homepage

IUPAC-Nomenklatur

Nomenklatur der Kohlenhydrate

Organ. Nomenklatur

Stoff- und Strukturdatenbanken

PDB-Datenbank > 13000 Proteine, DNA und Kohlenhydrate in 3D

Chemikalien Lexikon Chemikalienlexikon von Thomas Seilnacht

ChemFinder Chemie Web-Suchmaschine >75 000 Stoffe/Daten

ChemLin Alles zur Chemie in Datenbanken

C4 Computers at Cambrillo College Interaktive Moleküldatenbank (Chime) ca. 400

Chemdex sehr gute Datenbank für alle chem. Infos

Molecular Models >1350 3D Molekülmodelle mit Chime

Klotho: Biochemicals Database > 449 biochemische Stoffe

Pharmazeutisch aktive Stoffe 3D-Datenbank pharmazeutisch aktiver Stoffe: >400

Geruchsdatenbank ca. 50 Riechstoffe in 3D

RasMol-Homepage 3D-Datenbank biochem. Stoffe: Proteine, DNA usw.

Dr. Robert J. Lancashire, Jamaica verschiedene 3D-Modelle PDB-Format

Mathmol 3D-Datenbank biochemischer Stoffe

Moleküle des Monats (Bristol) verschiedene spezielle org. Stoffe in 3D

Atomorbitale 3D-Tutorial (Chime)

Aminosäuren 3D-Datenbank der biolog. Wichtigen Aminosäuren

SWISS-Image 3D-Datenbank (Proteine etc)

Makromolekulares Museum 3D-Datenbank (As, Proteine, DNA, Viren etc)

Image Gallery Biomoleküle Jena 3D-Datenbank (As, Proteine, DNA)

Klassische Chem. Reaktionen Datenbank chem. Reaktionen

ChemExper Stoffdatenbank

ChemCom Stoff- und Strukturdatenbank

Physics resources databank Physikalische Eigenschaften und Konstanten

Biokatalysen Datenbank University of Minnesota (>1000 Reaktionen, Stoffe usw)

Experimente

Experimentalchemie.de/ schöne Seite zur Experimentalchemie

Chemieexperimente.de Experimente zur Schulchemie

Chemieexperimente.de Experimente zur Schulchemie

Reaktionen/Animationen

Glycolyse I; II; III; versch. Animationen

Gärung Animation

Citratzyklus interaktive Animation

Atmungskette Animation

Beta-Oxidation Animation

Kohlenhydratstoffwechsel Animation

Organische Reaktionen chemische Reaktionen organischer Stoffe

Chem. Reaktionen/Stöchiometrie

Chemische Reaktionen Animationen und Tutorials

Rhodopsin Animation

Häm und Eisen

Intermediärstoffwechsel interaktive Animation

Zellstoffwechsel interaktive Animation

Insulin/Glucagonwirkung Animation/Lernprogramm

AchE-Inhibition Animation

Chemie der Drogenwirkung Animation und Lernprogramm

Stoffwechsel Alle wichtigen Stoffwechselwege in 2D+3D

Harnstoffzyklus und N-Stoffwechsel Lernprogramm

Alles zu Metabolismus/Biochemie Linkliste Biochemie

Stoffwechselwege verschiedene Animationen

Alles zu Biochemie Lernprogramm

Linkliste Biochemie

Lipide und Membranen Animation

Interaktive Biochemie Linkliste und Animationen

ATP-Synthase Animation

Bakterienstoffwechsel verschiedene Animationen

Themen/Tutorials

Thermodynamik Tutorial Susanne Metzger

Säure-Base-Tutorial (Englisch)

Tutorial organ. Chemie (Englisch)

Tutorial organ. Chemie (Englisch) Michigan State University

Tutorial organ. Chemie (Englisch) Uni North Carolina

Chemiluminiszenz-Homepage (Englisch)

Säure/Base Titration Interaktive Simulation

Tutorial Allgem. Chemie (Englisch) Uni Alberta

Aledyde und Ketone (Englisch) Washington State University

Reaktionen mit Aldehyden und Ketonen Norh Lake College (Englisch)

Elektrophile Addition (Englisch)

Elektrophile Addition Uni Paderborn

Alkane, Alkene, Alkine, cis/trans ... Bluffton College (Englisch)

Tutorial Organ. Chemie (Englisch) Portland State Uni

Tutorial Chemie (Englisch) Spitzen- Tutorial von Warwick R Bailey

Tutorial Chemie (Englisch) Spitzen- Tutorial von SparkNotes

Chemie-Links

http://www.schulchemie.de/index.htm
Alles über Schulchemie

http://www.seilnacht.tuttlingen.com/
Chemieseite von Th. Seilnacht

http://www.chemieexperimente.de/
Chemieexperimente

http://alp.dillingen.de/projekte/cii/chempge/chem1.htm
Schulchemie

http://www.chemie.uni-ulm.de/experiment/archiv.html Experiment des Monats

1 .http://www.chemie.uni-ulm.de/experiment/lit.html
2. http://www.anachem.umu.se/cgi-bin/pointer.exe?Courses
3. http://www.csun.edu/~vceed002/chem.html
4. http://home.ptd.net/~swenger/

Linkliste Chemie1
Linkliste Chemie2
Linkliste Chemie3
Linkliste Chemie4

http://www.uni-bayreuth.de/departments/didaktikchemie/ Unterrichtsmaterialien Uni Bayreuth

http://www.uniterra.de/
PSE

http://educeth.ethz.ch/chemie/diverses/
Unterrichtsmaterialien der Uni Zürich

http://www.chemie.de/~knecht/
Die Homepage für Chemiker

http://www.claessen.net/chemistry/
Chemie Index

http://www.chemlin.de/
ChemLin
Alles zur Chemie

http://www.chemie.de/
Chemie-Portal

http://www.chemie.uni-halle.de/allg/chemikalien.html
Chemikalienliste

http://members.tripod.de/stuhli/links.html
Links Prof. Stuhlpfarrer

http://chemwww.byu.edu/ora/
Animation organ. Reaktionen

http://www.cem.msu.edu/~parrill/
Linkliste org. Chemie Uni Memphis

Ernährungslehre-Links

http://www.nutriinfo.de
Alles über Ernährung:
Justus v. Liebig Uni Giessen

http://www.uni-hohenheim.de/~wwwin140/info/info.htm
Alles über Ernährung:
Uni Hohenheim

http://focus.de/D/DG/DGD/DGD04/dgd04.htm Ernährung FOCUS

http://home.t-online.de/home/gerhard_reuter/kel.htm Ernährung Kinder und Jugendlicher

http://www.bier.de/ Alles über Bier

http://pro.agrar.hu-berlin.de/cdrom/bmelf/bml/bml.htm BML

http://www.pharmacon.net/praxis/px-nutri.htm Ernährung und Krankheit

http://www.verbraucherzentrale.de/ernaehrungindex.html Verbraucherzentrale BW

http://www.vfed.de/ VFED

http://www.dge.de/Pages/navigation/index.html
DGE

http://www.aid.de/aid.htm
Zeitschrift AID

Quellen zu 3D-Molekülanimationen Online
Biomoleküle	http://www.nyu.edu:80/pages/mathmol/library/life/life.html
Biochemie	http://colossus.chem.indiana.edu/supplement.html
Molekülanimationen	http://www.leeds.ac.uk/bionet/animation/mol_anim.htm
Molekül-Museum	http://topaz.kenyon.edu/depts/bmb/chime/gallery.htm
Moleküle	http://c4.cabrillo.cc.ca.us/
Index Biomoleküle:	http://www.umass.edu/microbio/rasmol/tutbymol.htm http://www.umass.edu/microbio/rasmol/edsites.htm
Molekul-Daten für Chime:	http://www.umass.edu/microbio/rasmol/whereget.htm
Daten für Molekulargenetik	http://ndbserver.rutgers.edu/NDB/NDBATLAS/index.html
Enzym-Daten:	http://molbio.info.nih.gov/cgi-bin/pdb/doc/mrus/searching.html
Protein-Daten:	http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/data/scop.1.html